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HD5000 多谱超分辨菌落成像系统
HD5000多谱超分辨菌落成像系统是迅数科技2020出品、软硬件**配置的旗舰机型,符合人体工学的全金属机箱设计,精致、坚固。
独特设计的平皿莱因伯格照明系统,具有156种组合照明模式,可为平皿、多孔板菌落、细胞克隆、病毒蚀斑拍摄华美的影像,是图像数据保存、文献发表的有力工具。
4/3英寸超大面阵CMOS传感器与大视场高清定焦镜头搭配,菌落影像通透、色彩细腻,**展现培养基深层微小菌落,抑菌圈轮廓清晰、锐利,保证了图像分割的精度和重现性。
软件功能丰富、易用,融菌落计数、抑菌圈测量、菌种筛选三大功能于一体。可实现:快速统计、多算法高级统计、网格滤膜、3M测试片、典型菌筛选、菌株特性描述、双圈分析、抑菌圈测量。。。
微生物平皿成像的“数字影棚”
l“数字影棚”的光源控制
专业设计的平皿载样舱,可实现培养皿的雾光漫反射照明、悬浮暗视野照明、彩色凌透背光照明、多谱莱茵伯格照明,紫外激发照明,拍出不同寻常的科研级精美照片。
光源控制器采用隐藏式吸弹门设计,具6路照明选择开关、4通道无级亮度调节、双通道色温调节、12路彩色背景选择、12路莱因伯格光选择。
l多谱莱因伯格照明
多谱莱因伯格照明是迅数**的平皿大视场暗域照明技术,12通道不同波长的可见激发光以环幕逆透射聚光照明菌落,辅以不同的彩色凌透光,可构成156种组合照明模式,使培养基形成均匀的背景色,菌落勾勒出鲜亮的自然色泽与轮廓。
无需化学染色,即可使菌落或细胞克隆实现无损光着色,便于观察细微结构,识别、计数。
莱因伯格照明实际样张:
l悬浮式暗视野照明
悬浮式暗视野由暗域轮廓光与黑色背景构成。柔和的白色LED轮廓光,使平皿中央到边缘的菌落得到均匀的照明,而光线几乎穿透培养基,形成黑色背景下的亮色菌落,菌落与培养基形成高反差,可清晰勾勒菌落轮廓。
超分辨率 锐利展现菌落细节
1.1英寸大视场高清定焦镜头,通过较大程度地控制多种像差,无论是暗视野照明、雾光漫反射照明、莱因伯格照明,都能呈现高分辨力、高对比度的画质。
2100万像素 4/3英寸超大面阵彩色SONY CMOS 传感器,采用双层降噪技术,具有极高的灵敏度以及超低噪声,能以无损图像品质呈现细微的色差和丰富的细节信息。
高保真镜头与大面阵相机的**搭配,更能区分不同菌落、菌落与杂质、菌落与培养基之间的差异,从而提高菌落计数、筛选的精度。
更多图像算法 提高菌落计数精度
迅数创造性地研究出适合复杂菌落分割计数的快速活动轮廓模型、多相水平集活动轮廓模型等先进的图像分割技术,实现了复杂菌落、高难度平皿的准确计数。
(a) 水平集函数示意(b) 曲线演化过程
水平集活动轮廓模型的基本原理
图像识别分割案例:
多粘连细菌菌落计数
微小菌的识别计数:适合支原体、AMES 、嗜冷菌分析
真菌菌落计数
滤膜菌落的识别计数
显色菌落的识别计数
高效、精确 菌种数字化筛选
l无损伤的多谱光学染色识别技术
通过多光谱莱茵伯格照明的光学染色技术,让菌落或克隆形成鲜艳的颜色,便于观察、辨别菌落的色彩和纹理细节,结合染色抗干扰精密统计技术,可以提高不同菌落识别的精度,减少培养基不平整、杂质干扰的影响。
l不同菌群自动分类识别
微生物研究中有时需要在多菌混杂情况下把目标菌分类统计出来。不同菌种菌落的色泽、大小、轮廓存在微小特征差异。
HD5000的“单色分类统计、指定多色筛选、多色自动聚类”工具可实现高精度识别某一类菌落,或自动聚类区分不同颜色的菌落。
l双圈分析
通过精确测量透明外圈直径和菌落直径,自动计算二者面积比和直径比,并根据比值的大小自动排序,定位出相应的菌落。适用于“抑菌圈、透明圈、变色圈、生长圈、水解圈、溶磷圈、排油圈、溶钙圈、溶血圈”分析,辅助抗生素、酶制剂、有机酸产生菌和石油、农药降解菌的高效筛选。
l病毒滴度分析-蚀斑/噬菌斑计数
悬浮式暗视野照明使得敏感细菌菌层为白色,烈性噬菌斑形成的透明斑为黑色;莱茵伯格照明可让结晶紫或中性红染色的细胞层着色明艳,病毒空斑更易观察。影像的锐度与反差,帮助实现蚀斑/噬菌斑的准确分割和精确计数。
l菌丝生长速率分析工具
菌丝生长速率、菌丝生长抑制率、对峙培养分析、室内毒力测定等实验常采用十字交叉法测量菌落直径。由于多数霉菌菌落蔓延、疏松、边缘发散不规则,测量的人为误差大,效率低。迅数“霉菌一键测量”模块,只需用“魔棒”在菌落边缘点击一次,即可瞬间测出大霉菌的面积、周长、长径、短径。
l免疫学研究
迅数-多区域统计算法可以轻松实现任意多个区域的同步一键计数,可用于肺炎链球菌荚膜多糖特异性抗体调理吞噬杀菌试验(OPKA)和抗体依赖补体介导的体外血清杀菌试验(SBA)
l多孔板克隆计数
高分辨率的HD5000还可用于多孔板的克隆成像。莱茵伯格照明能使结晶紫染色的肿瘤或干细胞克隆鲜艳明亮;悬浮式暗视野照明,可使软琼脂克隆形成高反差的图像,自动计数大于50um的克隆或细胞团。
lSpot assay 点阵分析
Spot assay常用于检测不同培养液中细菌或酵母的生长率、培养液的连续梯度稀释或某个菌株基因突变型的高通量筛选 。“多区域动态调节统计”适用于此类分析。
抑菌圈自动测量
lSzone 抑菌圈多模式测量技术
抑菌圈测量常采用钢圈双碟法、纸片法、琼脂打孔法,由于试验环节诸多因素,如:抗生素溶液浓度、培养基质量、PH值、试验菌菌龄、培养时间等,使得*后形成的抑菌圈有些轮廓清晰,有些边缘模糊或不整齐并伴有破裂现象。
迅数“自动检测、拟圆逼近、三点定圆”三种算法,可适应不同类型抑菌圈的测量。
l高对比、高分辨成像---保证测量精度
抑菌圈测量的关键是准确找到透明圈与底层菌的“边界线”。迅数**设计的悬浮式暗视野,使得透明的抑菌圈构成“黑背景”,与周边灰白色的菌层形成高反差。
测量精度取决于数字影像画质,而镜头与相机的组合对画质至关重要。HD5000采用光学分辨率达150LP/mm的大靶面定焦镜头,将通透无畸变的光信号通过4/3英寸大面阵CMOS芯片相机,转为高清细腻的抑菌圈数字图像。
l抗生素效价测定
提供一剂量法、二剂量法、三剂量法及合并计算。一剂量法符合美国药典,二剂量法和三剂量法符合中国药典2020版。仪器重复性自检,测量相对误差≤0.002mm;均匀性自检,相对误差≤0.1%。
主要功能与技术指标
一、照明系统
?全封闭钢铝合金机箱(32×34×46cm):精密、坚固,确保光密闭
?平皿载样舱:下拉式铝合金隔断窗,消除环境杂散光干扰,阻断紫外泄露、避免灰尘进入
1)96颗LED列阵与纳米反射材料构成嵌入式雾光系统,360°连续漫反射,凸显菌落色泽和纹理,消除玻璃培养皿折射形成的光斑、光环。
2)色温变化范围:3100K-5800K照度范围 50-—7000 Lux
3)LED寿命≧20000 小时
白色LED光源,照度范围 100—5500 Lux 显色指数74%
?彩色(12色)凌透背光照明
1)可调式LED导光列阵,形成均匀、高亮的12种色彩透射光
2)照度均匀度大于90%,确保培养皿边缘与中间得到均匀照明
1)12通道可见激发光、环幕逆透射,与凌透背光可构成156种组合照明模式
2)多光谱模式可降低培养基不平整、色变的影响,减少琼脂杂质的干扰
3)无损光着色技术与抗干扰精密统计技术结合,增强菌落之间细微颜色差异辨别,显著提高菌落识别、筛选的精度
?紫外反射光源:254nm用于腔体消毒、紫外诱变 ;366nm 可用于荧光激发
?光源控制器
1)隐形弹吸式控制面板,6路照明选择开关、4通道无级亮度调节、双通道色温调节
2)照明组合 自由切换
二、数字成像
?1.1英寸大靶面高清工业定焦镜头,镜头中央与边缘都保持150 lp/mm的分辨率
?超大面阵CMOS相机: SONY 4/3英寸彩色CMOS 传感器,
分辨率:2100万像素
单像素尺寸:4.54X4.54um
三、菌落分析模块
1.基本菌落计数功能
?平皿类型:倾注、涂布、膜滤、螺旋平皿、3M纸片
?全皿菌落统计:菌落总数统计,并按25档尺寸分类显示
?区域选择统计:可选择圆形、矩形、任意圈定区域进行统计
?多域平行统计:一次性多区域同步统计;多区域“镂空”统计
?直径分类统计:设置直径范围,统计特定大小的菌落
?鼠标点击统计:快速标记、添加菌落,适合培养皿边缘菌落的计数
?菌落粘连分割:自动分割相互粘连的菌落,链状菌落由用户选择分割或不分割
2.快速菌落统计
?滚轮参数调节统计(4种):均质平皿、背景不均、微小菌落、彩色背景
?一键响应统计(3种):单色统计、霉菌统计、反式统计
?动态调节统计:可对统计结果进行动态调节修正,快速获取**统计效果。
?偏差预估统计:适用于菌落颜色多且复杂的情况。
?水平集多模型算法:搜索运算,获取**图像分割效果,适应培养基背景变换
?特定菌落统计:根据菌落色泽、大小、轮廓特征,识别特定菌落
?反式统计:适合菌落类型极其复杂而培养基背景均匀
?高粘连菌统计:适合多重粘连菌的分割计算
?杂菌、杂质剔除:根据形态、尺寸、颜色的区别,进行自动杂菌、杂质剔除
?螺旋菌落统计:根据FDA标准自动计数螺旋平板,支持指数模式、缓慢指数模式、均一模式、比例模式、草坪模式等。兼容美国SBI、西班牙IUL螺旋接种仪。
4.网格滤膜与3M测试片
?黑色实线网格一键统计
?3M细菌总数测试片、3M金黄色葡萄球菌测试片:一键统计
?3M大肠菌群测试片、3M大肠杆菌/大肠菌群快速测试片:一键统计+人工选择
5.典型菌筛选
?单色分类统计:根据颜色精度、扩散度和菌落大小、轮廓特征,筛选特定菌落
?多色自动聚类:根据颜色聚类精度,自动区分24种不同颜色的菌落
?指定多色筛选:一次筛选1-8种指定颜色菌落
?透明圈特性分析:适用于抑菌圈、水解圈、变色圈、溶钙圈、溶血圈、排油圈、溶磷圈分析
?双色圈自动筛选
6.菌落特征描述
?细菌、酵母:颜色、大小、形状、表面形态、边缘、光泽、透明度等特征,智能描述和排序
?霉菌、放线菌:正面颜色、反面颜色、大小、表面形态、边缘、质地等特征,智能描述和排序
7.微生物限度分析工具
?培养基适用性检查
?控制菌检查-菌落形态
8.专项分析
?防霉检测:定量分析防霉等级
?多区域串联统计:适合培养基背景不均匀的复杂菌落
?多区域并联统计:适合多孔板、OPKA、SBA分析
9.高级工具
?网格清除:消除滤膜网格背景干扰
?人工计数修正:添加或删除菌落
?排除污染区域:鼠标勾勒任意污染区域,自动剔除污染区域的菌落数
?背景文字清除:自动消除记号笔干扰
?人工粘连分割:手动分割多重粘连菌落
?参数自动换算:培养皿直径、样本稀释度输入,实现自动换算
?文字、图形标注:各类绘图工具和中英文文字嵌入
10.标定与测量
?仪器标定:仪器自带标定、人工修正标定
?一键式快速测量:一键测定大菌落,适合真菌、放线菌的单菌落分析
?全皿自动测量:全皿菌落的等效直径、面积、长短径、周长、圆度分析
?多向标尺测量、手动精确测量:长度、角度、弧度、面积、弧线、任意曲线
11.图像处理
?图像调节:灰度图、负相图转换;亮度、对比度、饱和度调节;RGB调节
?图像增强:锐化、自适应增强
?图像滤波:中值滤波、高通滤波、高斯滤波、低通滤波、队列滤波、高通高斯
?边缘检测:Sobel算子、Robert算子、Laplace算子、垂直检测、水平检测
?形态学运算:腐蚀、膨胀、开运算、闭运算
四、数据安全与管理
1.“系统、数据、操作、复核”四重系统架构,分设职能与权限,确保数据信息的安全、完整和真实
?系统管理员(**层):负责创建、管理所有操作员与审核员的账户和登入密码。确保操作员与操作员之间、操作员与审核员之间的账户隔离与数据隔离。
?数据管理员(副高层):负责全部测试数据的档案管理、以及计算机的数据库管理。封存所有审核通过的测试报告或将原始图片、测试数据备份、导出,保证了数据的完整性、安全性。
?操作员:负责培养皿菌落的测试、自检、修正、形成电子报告、递交审核、对审核通过后的文件进行报告打印。
?复核员:负责对操作员递交的测试报告进行审核。核查数据输入与处理过程,但无权修改;对存疑报告作“审核退回”处理,要求操作员重新测试;对“审核通过”的报告将**性存档,无论审核员还是操作员都无权再删除,以确保数据的原始性和真实性。
2.数据存储与导出
?以电子数据为主,记录:样本来源、编号、稀释度、平皿图片、识别效果、计数值、所用统计工具、参数设置、修正情况,确保记录信息完整。
?满足质量审计,存储的电子数据能以PDF或Excell格式打印输出
3.水印签章技术、防篡改技术、测试流程智能重构技术,实现有效的审计追踪
?防篡改技术
1)采用多用户登入管理,所有操作员、审核员的名字,被系统自动记录在操作流程和测试报告中;所有操作日期、审核日期,由计算机自动生成,避免错填或伪造。
2)全部操作流程,包括:菌落图片、培养皿尺寸、样本稀释度、统计工具、所用参数、测试所得的菌落总数、自检修正后的菌落总数等,由计算机自动记录在数据库中,操作员无法进行改动,为后续审计提供全部真实数据。
?水印签章技术
“审核通过”的测试报告会自动生成操作员和审核员的账户电子签名,并在报告上加印防伪的“审核通过”水印签章。
?测试流程的智能重构技术
1)“复核员”打开“等待审核”的测试记录,计算机自动复原操作员的全部流程和测试环境,包括:当时所测的培养皿图片、测试结果、培养皿尺寸、样本稀释度、采用的统计工具及所用参数、测试所得的菌落总数、修正情况……
2)通过测试环境和测试流程的重现,复核员可以追溯操作员的全部操作,复核测试结果的准确性,达到审计追踪目的。
五、抑菌圈分析模块
1.Szone 抑菌圈多模式测量技术
?自动检测:基于抑菌圈轮廓的精确边缘检测,适合边缘清晰、圆形抑菌圈
?拟圆逼近:基于抑菌圈轮廓的圆形拟合逼近,适合边缘破裂、非标准圆形抑菌圈
?人工检测:鼠标点击抑菌圈边缘上三点成圆,适合边缘模糊的抑菌圈
2.抗生素效价测定
?一剂量法效价检测:适合美国药典
?二剂量法、三剂量法及合并计算:适合中国药典2020版
?重复性自检:相对误差≤0.01%、重复测量精度 ≤0.002mm
?均匀性自检:相对误差≤0.05%
?台间测量差异≤0.2%
3.舒巴坦敏感β-内酰胺酶检验
?纯水验证:根据(A)、(B)、(D)产生抑菌圈,D-C≧3, B-A≦3 ,判定系统成立
?自动检测三个平行样本的(A)、(B)、(C)、(D)抑菌圈,并数据导入
?自动计算平行试验平均值,智能判别结果的阴阳性。
?无效报告自动预警
六、仪器规格与配置
?多谱超分辨菌落成像系统主机1台
?菌落分析软件、自动抑菌圈测量软件、抗生素效价测定软件、舒巴坦敏感β-内酰胺酶检验软件
?高端一体电脑::双核四线程CPU/4G内存/1T硬盘/23"高清屏,Windows 10系统
杭州迅数科技有限公司
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